Die Bilanzsumme von Merck zum 31. Dezember 2007 betrug 14.922 Mio € und erhöhte sich damit stark gegenüber dem Vorjahresstichtag um 6.820 Mio €. Wesentlicher Grund für diesen Anstieg ist die Akquisition von Serono: Die Vermögenswerte und Schulden der früheren Serono-Gruppe sind nun im Konzernabschluss der Merck-Gruppe enthalten. Sie sind nach IFRS im Rahmen der Erstkonsolidierung und der hierbei durchzuführenden Allokation des Kaufpreises mit ihren höheren beizulegenden Zeitwerten anzusetzen. Für den Kauf der Serono-Anteile wurden 10.271 Mio € aufgewendet. Außerdem wurde die Holdinggesellschaft Bertarelli Biotech S.A. (jetzt: Merck Serono S.A.) zu einem Preis von 571 Mio € erworben. Die Holdinggesellschaft wies in etwa gleicher Höhe flüssige Mittel auf. Der Kaufpreis in Höhe von 10.271 Mio € entfiel dabei überwiegend auf immaterielle Vermögenswerte (Technologien, Lizenzen und andere Rechte) sowie übernommene Vorratsvermögen und Sachanlagen. Ein verbleibender Unterschiedsbetrag wurde als Geschäfts- und Firmenwert ausgewiesen. (Details zur Kaufpreisallokation von Serono siehe Konzernabschluss).
Mit dem Verkauf der Sparte Generics sind Vermögenswerte dieses Geschäfts in Höhe von rund 1.615 Mio € abgegangen.
Im 1. Quartal 2007 wurde eine Kapitalerhöhung zur Refinanzierung des Erwerbs von Serono durchgeführt. Dabei wurde das Grundkapital um nominell 34,5 Mio € (mit Aufgeld rund 1.036 Mio €) auf nominell 168 Mio € erhöht. Die E. Merck OHG hat ihren Anteil um nominell rund 34 Mio € (mit Aufgeld rund 1.019 Mio €) erhöht. Der Merck KGaA sind aus der Kapitalerhöhung durch die Ausgabe von 13.278.927 neuen Aktien und die Erhöhung des Kapitalanteils des persönlich haftenden Gesellschafters E. Merck OHG somit rund 2.055 Mio € zugeflossen. Die Kosten der Kapitalerhöhung in Höhe von 18 Mio € wurden vom Eigenkapital abgesetzt. Die Anteile am Kapital betragen nach der Kapitalerhöhung 29,7 % für die Kommanditaktionäre und 70,3 % für die E. Merck OHG. Die Erlöse aus der Kapitalerhöhung wurden zur Rückführung von Krediten verwendet.

