Ziel des Kapitalmanagements ist die Sicherstellung der finanziellen Flexibilität zur langfristigen Aufrechterhaltung des Geschäftsbetriebes und zur Wahrnehmung strategischer Optionen. Die Beibehaltung eines stabilen Investment-Grade-Ratings, die Sicherung der Liquidität, die Begrenzung der finanzwirtschaftlichen Risiken sowie die Optimierung der Kapitalkosten sind Ziele der Finanzpolitik und setzen wichtige Rahmenbedingungen für das Kapitalmanagement. Merck nimmt Fremdkapital bevorzugt über Kapitalmärkte auf und besitzt ein Debt Issuance Program, welches einen raschen Zugang zum Kapitalmarkt ermöglicht. Darüber hinaus steht sowohl ein Commercial Paper Program in einem Volumen von 2 Mrd € zur kurzfristigen Finanzierung am Kapitalmarkt zur Verfügung als auch eine Syndizierte Kreditfazilität über 2 Mrd € mit einer Laufzeit bis Oktober 2014.

Die zuständigen Gremien des Merck Konzerns entscheiden über die Kapitalstruktur der Bilanz, die Eigenkapitalausstattung, die Verwendung des Bilanzgewinns, die Höhe der Dividende, die Finanzierung von Investitionen und über den Auf- und Abbau von Schulden.